Analyser les billes de TiO2

Voici un protocole pour analyser la resolution des images OCT utilisant des billes de TiO2 avec le logiciel: Imagej

1. Regler l'echelle de l’image en fonction de la resolution

Image > Scale..

Exemple: dans notre cas (X Scale: 1.636, Y Scale: 1.636 et Z Scale: 5.048) puis choisir interpolation: Bilinear

2. Changer le plan de vue:

Image > Stacks > reslice [/]..

Example: pour visualiser l'interieur du capillaire il faut se placer sur l'axe X, pour cela: (Start at: Left)

3. Sélectionner une slice au centre du capillaire

Image > Stacks > Tools > Make Substack..

Exemple: Slices: 124 puis selectioner Delete slices from original stack

4. Sélectionner zone interet dans le capillaire pour croper l’image

Image > Crop..

5. Selectionner une ligne qui contient des billes a analyser

Analyze > Plot Profile..

A partir de cette coupe de profil il est possible de calculer la resolution a partir de FWHM.